김일성종합대학교기는 기폭의 바탕색이 붉은색이며 중심 웃부분에는 대학마크를, 밑부분에는 《김일성종합대학》이라는 대학명칭을 새긴 기발이다.
기폭은 가로의 길이가 3m이고 세로의 길이는 1.8m이다.
김일성종합대학교기는 평양미술대학에서 창작하였다.